Ktoś napada na samochód policyjny transportujący LJ i Lincolna. ..
Okazuje się, że to ludzie, którzy mają za zadanie doprowadzić ich do jego ojca. Sara rozkodowała wiadomość od Michaela, nocowała we wskazanym przez niego Hotelu, a następnie udała się w wyznaczone miejsce spotkania. Scofield spotyka Sarę… jednak okazuje się, że nie są oni sami na tym pustkowiu. Mahone rozpoczyna pościg za Michaelem. Bellick i jego kompan zostawiają T-Baga samego w mieszkaniu i dzwonią po policje.
Agent Mahone wpada w pułapkę Michaela. Bellick i Geary odnajdują pieniądze pieniądze, jednak ten drugi postanawia zachować zdobycz jedynie dla siebie…

Do Michaela i Sucre dołączają Lincoln z jego ojcem. Kellerman stara się zabić Sarę, ale na szczęście nie udaje mu się to…
Mahone znajduje miejsce w którym Scofield załatwiał sprawy samolotu. Ojciec Lincolna zostaje postrzelony przez agenta Mahone.
Policja znajduje komórke Roya z wiadomością, jaką nagrał mu Bellick, co w konsekwencji sprawia, że zostaje on oskarżony o morderstwo przyjaciela. Zgodnie z umową, na pasie startowym pojawia się samolot, który ma zabrać Lincolna, Michaela i Sucre do Panamy…

Scofield i Lincoln zostają aresztowani…
drzutowiec stara się zestrzelić samolot, którym podróżuje Sucre, na szczęście udaje mi się w ostatniej chwili wyskoczyć ze spadochronem. T-Bag poznaje pracownice poczty, która załatwia mu aktualny adres jego ex-dziewczyny, która go zdradziła. Wyroki Lincolna i Scofielda zostają zmienione, odpowiednio na: natychmiastową egzekucje i dożywocie. Bellick zostaje skazany na 25 lat więzienia. Agenci Kellerman i Mahone organizują małe zamieszanie w tunelu, którym przejeżdża konwój z więźniami, dając im tym samym szanse na ucieczkę, aby mieć powód do zabicia ich.

Kellerman i uciekinierzy zaczynają działać we wspólnym interesie…
Kellerman przemyca Linca i Michaela przez blokady na drodze i wiezie na lotnisko skąd polecą na spotkanie jedynej osoby która może im pomóc przestać uciekać-Teerence’a Steadmana, rzekomo zabitego przez Lincolna. Bill Kim w obawie przed nimi każe przetransportować Teerence’a w bezpieczne miejsce, lecz Kellerman i bracia są na miejscu pierwsi…porywają brata wice prezydent i chcą przewieźć go do Waszyngtonu  żeby udowodnić że żyje…W Fox River gdzie zamknięto Bellicka zapanowały nowe zasady ustalone przez nowego naczelnika, niestety w więzieniu nie rządzą już strażnicy…